Nel 1263 Manfredonia fu ufficialmente riconosciuta. Passò in mano agli Angioini, agli Ungheresi, agli Aragonesi ed ai Veneziani. Manfredonia resistette all’attacco dei Francesi e rimase in mano all’imperatore Carlo V. Poi andò in mano agli Spagnoli sotto cui subirono l’attacco dei Turchi con gravi perdite. L’arcivescovo sipontino Annibale ridiede vita alla città ma solo al XIX secolo la situazione divenne decente. Nel 1910 Manfredonia fu colpita dal colera e dei giovani si riunirono in un gruppo, la Croce Verde, che aiutava chi stava male.
Durante la Prima Guerra Mondiale fu tra le prime città a essere bombardata dagli Austriaci nel 1915. Fu colpita la stazione ferroviaria con 100 bombe e le tombe che vi sono tuttora ricordano l’accaduto. Lo stemma di Manfredonia raffigura il Vescovo San Lorenzo Maiorano, Vescovo di Siponto, su di un cavallo bianco. Il Vescovo sta attraversando un ponte con sotto un drago. Lo stemma riporta la scritta S.P.Q.S. (Senatus Populusque Sipontinus). Il Gonfalone è azzurro, ha in centro la scritta “città di Manfredonia” e lo stemma.
A Manfredonia tra le architetture militari troviamo il Castello svevo-angioino-aragonese. Tra le architetture religiose da visitare ci sono la Cattedrale, la Basilica di Santa Maria Maggiore di Siponto, l’Abbazia di San Leonardo, la Chiesa di San Domenico, il Convento di Santa Maria della Vittoria, la Chiesa della Sacra Famiglia. Le architetture civili più importanti di Manfredonia ci sono il Palazzo San Domenico, il Palazzo Mettola, il Palazzo de Nicastro, il Palazzo delli Guanti, il Palazzo Celestini, il Palazzo de Florio ed il Palazzo delli Santi. I luoghi di interesse naturalistico sono la Grotta Scaloria ed il Lago Salso.
Gli eventi più importanti di Manfredonia sono la Festa Patronale in onore di San Lorenzo Maiorano (7 febbraio), il Carnevale Dauno, il Premio Hargos Hippium, la Festa Patronale in onore di Maria Santissima di Siponto (dal 28 agosto al 1 settembre), il Premio Nazionale Poesia città di Manfredonia, il Premio Nazione di Cultura Re Manfredi e il Premio Internazionale di canto lirico.
Il settore più sviluppato a Manfredonia, come nella maggior parte delle città di mare, è il turismo. Esso dipende soprattutto dagli insediamenti balneari di Siponto e nella parte Sud della città. Il turismo è incentivato dal porto vicino al molo e il collegamento con la Costa Garganica e con le Isole Tremiti. Importanti sono anche l’agricoltura e la pesca.




